Topografia e Arkipelagut Japonez eshte intensivisht e valezuar me zona malore, duke zene rreth tre te katertat e vendit.Shumica e ketyre zonave malore jane formuar ne menyre te pjerret per shkak te efektit gerryes te shumte.E vendosur në "unazën e zjarrit" rreth Paqësorit, Japonia është kryesisht malore - rreth tre të katërtat e tokës kombëtare janë male - dhe vargjet e gjata malore formojnë shtyllën kurrizore të arkipelagut. Alpet dramatike të Japonisë, të mbushura me maja 3000 metra, ndajnë pjesën qendrore të Honshu, ishullit kryesor.